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2017
07-31

Linux 下安装 numpy 和 scipy

Python下 SciPy 和 numpy 这两个科学计算包的依赖关系较多,安装过程较为复杂。

各个安装包:

scipy-0.19.0  下载:https://github.com/scipy/scipy/releases
numpy-1.9.0  下载:https://sourceforge.net/projects/numpy/files/NumPy/1.9.0/numpy-1.9.0.zip/download?use_mirror=nchc
nose-1.1.2   下载:https://pypi.python.org/packages/38/96/7aa1c2583ddec558a230175d6aeddba796cde7191852bf3e6eb3cfb873e1/nose-1.1.2.tar.gz
lapack-3.7.0   下载: www.netlib.org/lapack/lapack-3.7.0.tgz
atlas-0.27.0   下载: https://pypi.python.org/pypi/atlas/0.27.0

依赖关系:scipy 的安装需要依赖于 numpy、lapack、atlas(后两者都是线性代数工具包,而 numpy 和scipy 的测试程序的运行又依赖于 nose,因此,整个安装过程必须要按顺序执行的,否则是无法执行下去的。

安装步骤:
1、安装 nose

解压缩 nose 的安装文件,进入 nose 的目录,直接运行 setup.py 即可:

tar -zxvf nose-1.2.1.tar.gz  
cd nose-1.2.1  
python setup.py install

注意:python 命令可能是启动 python2 ,如果需要在 python3 环境下运行这些库,需要先安装 python3。

安装这些库时,使用 python3命令:python3 setup.py install 。(如果默认 python 启动 python3,则无需此)

2、安装 lapack

由于最新版本的 ATLAS 可以直接集成 lapack 的安装压缩文件进行编译,因此,如果仅在 python下使用的话,可以不用安装lapack。只需要下载压缩文件:lapack-3.7.0.tgz 即可。

3、安装ATLAS

tar -zxvf atlas-0.27.0.tar.gz  
cd atlas-0.27.0  
python setup.py install

4、安装 numpy

推荐使用源码安装:下载之后解压,进入文件夹,直接运行安装文件

unzip numpy-1.9.0.zip  
cd numpy-1.9.0  
python setup.py install

等待安装完成。
注意:在安装过程中,可能提示缺少 python-dev 或 python-devel,在 CentOS 系统中安装python-devel 即可。

测试是否安装成功:

5、安装scipy

tar -zxvf scipy-0.19.0.tar.gz
 
cd scipy-0.19.0
 
cp lapack-3.7.0.tgz
 
python setup.py install

等待安装完成。

注意:scipy 安装依赖于 lapack,因此在安装时,lapack 的压缩包复制到 scipy-0.19.0 的目录下,如果需要,可以将 lapack-3.7.0.tgz 解压。

也可以执行下面指令:

yum install lapack lapack-devel blas blas-devel

注意:如果在安装一个库之后,在没有退出这个安装文件夹之前,进入 python 环境,通过 import 导入库,则会有下面的提示:

“ImportError: Error importing numpy: you should not try to import numpy > from its source directory; please exit the numpy source tree, and > relaunch your python intepreter from there.”

这个时候应先退出安装文件夹,再进入 python 环境导入库。

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作者:saunix
大型互联网公司linux系统运维攻城狮,专门担当消防员